Es una de las secretarías de estado que integran el denominado gabinete legal del Presidente de México. Es el despacho del poder ejecutivo federal encargado de la administración, regulación y fomento de la actividad económica primaria (salvo los minerales y energéticos en manos de la Secretaría de Energía).
Es la encargada de diseñar, planear, ejecutar y coordinar las políticas públicas en materia agropecuaria. Lo anterior incluye conducir todo ello para el Desarrollo económico y social de las zonas rurales y comunidades pesqueras; crear y fomentar programas que garanticen la rentabilidad y sustentabilidad de actividades agropecuarias; dirigir y vigilar los sistemas de sanidad animal y vegetal; coordinarse con otras secretarías para, la formación de profesionales en el sector agropecuario (SEP), establecer precios a los alimentos (SE) e impulsar la investigación científica para el mejoramiento de la producción agropecuaria (Semarnat); y garantizar el acceso de los productores a tecnología y métodos para modernizar su sector.
De acuerdo con la Ley Orgánica de la Administración Pública Federal en el Artículo 35 le corresponde el despacho de las siguientes funciones:
Formular, conducir y evaluar la política general de desarrollo rural, a fin de elevar el nivel de vida de las familias que habitan en el campo, en coordinación con las dependencias competentes.
Integrar e impulsar proyectos de inversión que permitan canalizar, productivamente, recursos públicos y privados al gasto social en el sector rural; coordinar y ejecutar la política nacional para crear y apoyar empresas que asocien a grupos de productores rurales a través de las acciones de planeación, programación, concertación, coordinación; de aplicación, recuperación y revolvencia de recursos, para ser destinados a los mismos fines; así como de asistencia técnica y de otros medios que se requieran para ese propósito, con la intervención de las dependencias y entidades de la Administración Pública Federal correspondientes y de los gobiernos estatales y municipales, y con la participación de los sectores social y privado.
Organizar y fomentar las investigaciones agrícolas, ganaderas, avícolas, apícolas y silvícolas, estableciendo institutos experimentales, laboratorios, estaciones de cría, semilleros y viveros, vinculándose a las instituciones de educación superior de las localidades que correspondan.
Fomentar y organizar la producción económica del artesanado, de las artes populares y de las industrias familiares del sector rural, con la participación que corresponda a otras dependencias o entidades.
Elaborar, actualizar y difundir un banco de proyectos y oportunidades de inversión en el sector rural.
Organizar y mantener al corriente los estudios económicos sobre la vida rural, con objeto de establecer los medios y procedimientos para mejorarla.
Fomentar la actividad pesquera.
Conforme a lo dispuesto por el artículo 3.º del Reglamento Interior de la Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural, la representación, el trámite y la resolución de los asuntos competencia de la Secretaría, corresponde originalmente al Secretario del Despacho, quien para el estudio, planeación y despacho de sus atribuciones, contará con los siguientes:
Servidores públicos y unidades administrativas: Secretario del Despacho; Subsecretario de Agricultura; Subsecretario de Desarrollo Rural; Subsecretario de Fomento a los Agronegocios; Oficial Mayor; Coordinación General de Enlace y Operación; Coordinación General de Comunicación Social; Coordinación General de Delegaciones; Coordinación General de Política Sectorial; Coordinación General Jurídica; Coordinación General de Ganadería; Dirección General de Fomento a la Agricultura; Dirección General de Vinculación y Desarrollo Tecnológico; Dirección General de Apoyos para el Desarrollo Rural; Dirección General de Programas Regionales y Organización Rural; Dirección General de Estudios para el Desarrollo Rural; Dirección General de Servicios Profesionales para el Desarrollo Rural; Dirección General de Estudios Agropecuarios y Pesqueros; Dirección General de Administración de Riesgos y Proyectos de Inversión; Dirección General de Apoyo al Financiamiento Rural; Dirección General de Eficiencia Financiera y Rendición de Cuentas; Dirección General de Desarrollo Humano y Profesionalización; Dirección General de Proveeduría y Racionalización de Bienes y Servicios; Dirección General de Promoción de la Eficiencia y Calidad de los Servicios.